临床病理和病理科研工作是密不可分的，同时，病理科研工作也有着自己的特点。
细胞计数
    病理图像分析系统的应用，使得区域内细胞的绝对数和单位面积的细胞密度的计算成为一项简单的工作。
免疫组化计算
    研究表明应用图像分析技术对细胞核DNA含量进行定量分析，能较好地反映病理图像与DNA倍体分析，结果与流式细胞仪测定结果非常接近。亦有学者用计算机图像处理技术，对痰涂片中巴氏染色的角化性鳞癌细胞（KSCC）、非角化性鳞癌细胞（N KSCC）和腺癌细胞（ACC）胞浆进行了色度学定量分析，结果KSCC的红、绿、蓝色值显著高于N KSCC和ACC，且差值较大，而灰度在各组间的差值则较小，KSCC与N KSCC，KSCC和ACC的色度差值较大，差异较为显著，KSCC、N KSCC、ACC三组间饱和度差异显著，KSCC明显高于N KSCC和ACC，从而认为红、绿、蓝色值、色度、饱和度等描述图像色彩指标在KSCC和N KSCC、KSCC与ACC的渐变中有重要价值，其分辨的敏感程度由于灰度图像分析。免疫组化染色经DAB显色后阳性细胞呈棕色，再经过苏木素复染，将着一定的蓝色，这会在一定程度上影响对染色的判定。采用对媒体彩色图像分析系统进行定量分析，分别测定红、绿、蓝三种颜色的色值，可用来区分细胞对不同颜色的着色程度，并可通过三基色色值或计算色度、饱和度、灰度来对细胞呈现的色彩进行定量描述。本研究结果显示，对同一组织类型、同是免疫组化染色阳性的肺癌细胞，一些反映着色色彩的指标在不同分化程度之间确实存在着差别，这种差别单纯应用定性指标或形态学指标无法充分显示，图像分析技术则可弥补这一不足。
    以前，对于免疫组化宝搏体育阳性、中阳性、弱阳性的计算是不可能的，现在，病理图像分析系统的应用，是的这份工作变得十分轻松，对于科研工作中的比较有着重大意义。病理图像分析系统的应用，极大地丰富了病理科研工作的方法，使得病理工作人员的思路开阔了许多，使得一些原来不可能的工作如：腺体形态计算、DNA计算、AGNOR计算变得简单起来。