在之前我们介绍过生物显微镜景深的概念，景深的大小是指（前）景深前界到（后）景深后界之间的距离。景深前界是指位于调焦物点前方，与镜头距离zui近的能够清晰成像的物点所在的垂直平面。景深后界是指位于调焦物点之后的，与镜头距离zui远的能够清晰成像的物点所在的垂直表面。由景深前界到调焦物点的距离称为前景深；由调焦物点到景深后界的距离称为后景深。
    那么在使用生物显微镜时，如何使拍摄的图像更加清晰，增强层次感，我们就需要注意在实际拍摄中影响景深的因素由强到弱可分为以下三种：
    1.在实际拍摄过程中 ，光圈是对景深影响zui为明显的因素。在拍摄距离和镜头焦距不变的情况下，光圈越大，景深越小；反之，光圈越小，景深越大。为了有效控制拍摄景深，在摄像机的滤镜转盘上专门设置了灰镜档，并按照透光率的不同，分为三个档位：1/4、1/16、1/64。在实际拍摄过程中，有时为了达到小景深效果需要使用大光孔，为了弥补开大光孔导致的曝光过度，可以将灰镜加入光路中以阻挡过多的光量。
    2.焦距在光圈相同且拍摄距离相同的情况下，焦距越大，景深越小；反之，焦距越小，景深越大。而且，当镜头焦距短到一定程度时，其产生的影响景深的非常大的。比如鱼眼镜头的景深就很大。正因为如此，当使用超广角镜头进行拍摄时，由于可以有较大的景深，所以在跟拍运动物体时可以不必跟焦。
    3.拍摄距离也是一个很重要的因素，在光圈和焦距不变的情况下，拍摄距离越大，景深越大；反之，拍摄距离越小，景深越小。